Am 12.12.2004 hatte die Dreiländerbahn, eine Tochter der DB, den RB95 "Sieg-Dill-Bahn" von Dillenburg nach Au über Siegen übernommen. Dieser RB nutzt die Strecke Siegen - Giessen bis Dillenburg. Zum Einsatz kommen Dieseltrieb-wagen der Baureihen 640 und 648 (Lint 27 und Lint 41), obwohl die gesamte Strecke elektrifiziert ist. Die Bedienung der RB95 wurde inzwischen von der Hessischen Landesbahn (HLB) ebenfalls mit LINT-Fahrzeugen übernommen. Ab Dillenburg betreibt DB-Regio eine Regionalbahn-Linie via Giessen nach Kassel und Frankfurt mit Elektrotriebwagen der Baureihe 423.

Seit dem 10.12.2010 fährt die Hessische Landesbahn GmbH (HLB) den RE99 von Siegen nach Giessen und teilweise weiter nach Frankfurt. Dafür wurden von der Firma Stadler Pankow 9 FLIRT-Elektrotriebwagen beschafft: 3 dreiteilige 427 041 bis 427 043 und 6 fünfteilige 429 041 bis 429 046.

Ein großes Manko stellt die Tatsache dar, daß die RE 99 von und nach Siegen in Giessen keinen direkten Anschluß an die InterCity-Züge der DB haben, die alle zwei Stunden von Giessen Richtung Hannover bzw Heidelberg fahren. Die Um-steigezeit beträgt jeweils knapp eine Stunde. Hier sollten die Fahrplangestalter dringend für Verbesserungen sorgen.